虽然小儿癫痫的病因十分复杂，但随着医学科技的快速发展，大部分病因已被人们明确认识，总体来讲从病因学上可将癫痫分作两大类，一类是没有明确病因的癫痫，这一类癫痫占癫痫患者总数20%，大多与遗传有关，因此也称作隐源性癫痫或遗传性癫痫。另一类是可查出明确病因的癫痫，最常见的病因包括：
①神经皮肤综合症：最常见的有神经纤维瘤病，结节性硬化和脑三叉血管瘤病等。
②围产期脑损伤，主要是窒息、产伤、缺氧、颅内出血、缺血性脑病，其中以缺氧缺血性脑病而致癫痫者最常见。
③遗传代谢病，如高氨血症，苯丙酮尿症，维生素B6依赖症，脑脂质沉积症等。
④营养代谢障碍及内分泌疾病，常见有的低血钙、低血糖、维生素B6缺乏、低血镁，甲状腺功能低下。
⑤颅内感染：如病毒性脑炎、细菌性脑膜炎、霉菌性脑膜炎、脑脓肿、接种后脑炎、脑寄生虫病、传染后脑炎等。
⑥外伤：由外伤而致的颅骨骨折、颅内出血、脑挫裂伤等均可引起癫痫，但发病率与损伤程度及部位有关。
⑦脑血管病：如颅内出血、脑血管畸形、脑梗塞、脑血管炎等。
⑧先天脑发育畸形，如巨脑回畸形，无脑回畸形，灰质异位症，多小脑回畸形，先天性脑积水，脑穿通畸形，蛛网膜囊肿，肼胝体发育不全，巨脑症，头小畸形等。
⑨高热惊厥后脑损伤也导致癫痫。不论哪种原因引起的癫痫，积极治疗原发病，迅速控制发作，接受合理、正规、无毒副作用的治疗是疾病顺利康复的保证。
